一种脱除聚丙二醇单甲醚中低沸点杂质的方法，其特征在于，闪蒸脱除过程由多级错流蒸发器、控温系统、塔底加热系统及真空系统构成。首先打开真空系统、控温系统及塔釜加热温度，控制设定真空度及温度，原料由顶部第一级错流蒸发器加入，控制原料的加入量，原料在每一级错流蒸发器中横向流动，通过溢流管流入下一级错流蒸发器，直到流入釜底；每一级错流闪蒸蒸发器形成汽体由下一级通过导汽管导入上一级错流蒸发器，并由真空管导入冷凝器冷却，并经收集瓶水吸收，进入真空泵系统。处理后，塔底出料聚丙二醇单甲醚中醛值降为≤1.0ppm、甲醇量≤0.01%、水含量≤0.04%，无色无异味。